Ειδικότερα, το Εργαστήριο έχει ως αποστολή:

• Την υποστήριξη των ερευνητικών, επιστημονικών και διδακτικών αναγκών του Τμήματος Θεολογίας του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών σε προπτυχιακό και μεταπτυχιακό επίπεδο, σε θέματα Παιδαγωγικής και Θρησκευτικής Εκπαίδευσης.
• Την ανάληψη, οργάνωση, διεξαγωγή και εκτέλεση ερευνητικών, εκπαιδευτικών και επιμορφωτικών προγραμμάτων (εθνικών, ευρωπαϊκών ή/και διεθνών) για ίδιο λογαριασμό ή/και λογαριασμό τρίτων ή/και σε συνεργασία με τρίτους, (π.χ. νομικά πρόσωπα ιδιωτικού και δημοσίου δικαίου ή άλλους επιμορφωτικούς και πανεπιστημιακούς φορείς στην ημεδαπή και την αλλοδαπή).
• Τη διοργάνωση επιστημονικών διαλέξεων, ημερίδων, σεμιναρίων, θερινών μαθημάτων, συνεδρίων και άλλων πάσης φύσεως επιστημονικών εκδηλώσεων.
• Τη δημοσίευση των ερευνών που πραγματοποιεί, την έκδοση επιστημονικών εργασιών, την έκδοση ειδικού περιοδικού εντύπου, την παραγωγή εκπαιδευτικού υλικού και τη διατήρηση ιστοσελίδας με περιεχόμενο που ανήκει στους σκοπούς του Εργαστηρίου.
• Την ενίσχυση, μέσω ερευνών, μεταπτυχιακών φοιτητών, που εκπονούν διδακτορική διατριβή της οποίας το θέμα εμπίπτει στους σκοπούς του Εργαστηρίου, ιδίως με παροχή δυνατότητας χρήσης υλικού, με οικονομική υποστήριξη και με χορήγηση υποτροφιών.
• Τη συνεργασία με άλλα ελληνικά και αλλοδαπά ακαδημαϊκά ιδρύματα, επιμορφωτικούς φορείς ή κέντρα ερευνών, εφόσον οι επιστημονικοί στόχοι τους συμπίπτουν, συμβαδίζουν ή αλληλοσυμπληρώνονται με εκείνους του Εργαστηρίου σε πνεύμα αμοιβαιότητας.
• Τη συνεργασία με διεθνείς οργανισμούς, δημόσιες υπηρεσίες, σχολικές μονάδες, ΝΠΔΔ, Οργανισμούς Τοπικής Αυτοδιοίκησης, επιστημονικούς φορείς και ΝΠΙΔ ενδεικτικά αναφερομένων εταιρειών πάσης μορφής, στην ημεδαπή και την αλλοδαπή για τη μελέτη και υποβολή προτάσεων και μεθόδων προσέγγισης θεωρητικών καθώς και την αντιμετώπιση πρακτικών ζητημάτων, που αναφέρονται στους σκοπούς του Εργαστηρίου.
• Κάθε άλλη επιστημονική, ερευνητική, εκπαιδευτική και επιμορφωτική πρωτοβουλία ή δραστηριότητα που εμπίπτει στους σκοπούς του Εργαστηρίου.